DEPARTEMEN
PROTEKSI TANAMAN
FAKULTAS
PERTANIAN
INSTITUT
PERTANIAN BOGOR
2013
NOMENKLATUR
Cymbidium mosaic virus
Ordo: Tymovirales
Famili: Alphaflexiviridae
Genus: Potexvirus
Spesies: Cymbidium mosaic virus
Arti
Penting
Penyakit
yang disebabkan oleh CyMV adalah penyakit yang paling umum pada anggrek di
seluruh dunia yang memiliki dampak ekonomi. Adanya penyakit ini di Indonesia
untuk pertama kalinya dilaporkan Suseno (1976) pada Cattleya. CyMV merupakan
spesies dari genus Potexvirus dan famili Flexiviridae. Bentuk partikel virus
adalah memanjang, lentur dan panjangnya rata-rata 448 nm hingga 488 nm, tidak memiliki
enveloped dan memiliki RNA berukuran ±600bp (Lee & Chang 2006). Genom CyMV
merupakan ss-RNA linier dan berukuran 8.1 kb (Frowd & Tremaine 1977). CyMV
dapat ditularkan secara mekanik dengan cairan perasan, melalui perkembangbiakan
vegetatif, tetapi tidak dapat ditularkan dengan biji dan secara alami oleh
serangga vektor. CyMV di lapangan dapat ditularkan melalui kontak langsung
antara tanaman sakit dengan tanaman sehat, kontaminasi peralatan potong dan pot
selama perawatan dan pada saat panen bunga (Lawson 1995). CyMV dapat bertahan dalam cairan perasan
tanaman sakit pada temperatur 65oC selama 10 menit, tetapi tidak dapat
diinaktifkan pada temperatur 70 oC. Selain itu virus tersebut juga tidak aktif
pada tanaman yang direndam dalam air yang bertemperatur 45 oC selama 2 jam
(Smith 1972). Menurut Jensen (1951) CyMV
banyak menyerang spesies dalam famili Orchidaceae dan hanya beberapa spesies
pada famili lainya. Pada famili Orchidaceae virus ini dijumpai pada 8 genera,
yaitu Aranthera sp., Calanthe sp., Cattleya sp., Cymbidium sp., Grammatophyllum
sp., Phalaenopsis sp., Oncidium sp., dan Vanda sp. Gejala mosaik akan tampak lebih jelas pada
daun-daun muda berupa garis- garis klorotik memanjang searah serat daun. Bunga
pada tanaman Cattleya sp. yang terinfeksi biasanya memperlihatkan gejala
bercak-bercak coklat nekrosis pada petal dan sepal. Bunga biasanya berukuran
lebih kecil dan mudah rontok dibandingkan dengan bunga tanaman sehat (Jensen 1951). Pada tanaman Grammatophyllum
menunjukan gejala mosaik pada daun, pada tanaman Phalaenopsis menunjukkan
gejala mosaik, dan nekrosis pada bagian daun (Inouye 1996).
Sebaran
Cymbidium
Virus (CyMV) biasanya menular lewat luka
pada tanaman yang disebabkan oleh luka. Umumnya luka ini terjadi melalui
perbanyakan tanaman dengan menggunakan alat pemotong yang terkontaminasi .
Ketika dibudidayakan di rumah kaca ataupun pada tempat lain , CyMV menyebar
secara mekanis jika alat yang digunakan dalam budidaya tidak dibersihkan dengan
benar . Secara alami CyMV ditularkan serangga . Sebuah virus anggrek yang
berbeda , virus anggrek flek , dapat ditularkan oleh tungau Brevipalpus .Ada
juga bukti bahwa kecoa mampu mengirimkan CymMV .
Inaktivasi dan Inkubasi
CyMV
dapat bertahan dalam cairan perasan tanaman sakit pada temperatur 65oC selama
10 menit, tetapi tidak dapat diinaktifkan pada temperatur 70 oC. Selain itu
virus tersebut juga tidak aktif pada tanaman yang direndam dalam air yang
bertemperatur 45 oC selama 2 jam (Smith 1972). penelitian Gara (1995) yang menyatakan bahwa pada C. Amaranticolor
menunjukkan gejala lesio lokal yang diawali bercak berwarna hijau kemudian
bercak berubah warna menjadi hijau kekuningan pada 11-29 hari setelah
inokulasi, sedangkan pada D. stramonium gejala yang tampak berupa bercak
berwarna hijau yang kemudian berubah menjadi hijau kekuningan, dan lama
kelamaan berubah menjadi coklat, bercak klorotik dan nekrotik ditemukan pada
tanaman ini pada 10-14 hari setelah inokulasi.
Deteksi dan Identifikasi
Deteksi dan identifikasi secara serologi sudah umum
diaplikasikan untuk berbagai virus. Salah satu uji serologi adalah Enzyme
Linked Immunosorbent Assay (ELISA) yang pertama kali dikembangkan oleh
Clark dan Adam (1977). Metode ini berdasarkan pada reaksi antara antigen
antibodi.
Diagnosis CyMV yang dilakukan oleh Miin (2005); Hu et
al. (1993); Navalinskiene et al (2005)
dan Sherpa et al. (2007) dengan menggunakan metode serologi yaitu Double
Antibody Sandwich (DAS) ELISA pada tanaman anggrek jenis Arachnis,
Aranda, Asocentrum, Cattleya, Cymbidium, Dendrobium, Laelia, Oncidium,
Paphiopedium, Phalaenopsis, Renanthera dan Vanda berhasil dengan
baik. Metode serologi ini menggunakan antiserum monoklonal yang bereaksi secara
spesifik dengan protein selubung CyMV (Navalinskiene et al 2005).
Selain dengan menggunakan
metode serologi, deteksi dan identifikasi virus tanaman dapat juga dilakukan
melalui teknik molekuler misalnya dengan reverse transcriptase-polimerase
chain reaction (RT-PCR) (Sherpa et al. 2007).
Deteksi
CyMV pada plbs Anggrek Dendrobium dengan ELISA
ELISA
(Enzyme Linked Immunosorbent Assay) adalah suatu teknik deteksi dengan
metode serologis yang berdasarkan atas reaksi spesifik antara antigen dan
antibodi, mempunyai sensitivitas dan spesifisitas yang tinggi dengan
menggunakan enzim sebagai indikator. Prinsip dasar ELISA (Burgess 1995) adalah
analisis interaksi antara antigen dan antibodi yang teradsorpsi secara pasif
pada permukaan fase padat dengan menggunakan konjugat antibodi atau antigen
yang dilabel enzim. Enzim ini akan bereaksi dengan substrat dan menghasilkan
warna. Warna yang timbul dapat ditentukan secara kualitatif dengan pandangan
mata atau kuantitatif dengan pembacaan nilai absorbansi pada ELISA plate
reader.
Prinsip
pengujian virus dengan metode ELISA adalah antibodi (protein) virus yang
spesifik teradsorpsi pada permukaan lubang “polystyrene microtiter plate”. Antibodi
tersebut akan menangkap antigen (virus yang terdapat pada sampel). Selanjutnya
virus tersebut akan bereaksi dengan spesifik antibodi yang telah dilabel dengan
alkalin fosfatase. Ada tidaknya virus dalam sampel ditandai dengan berubahnya
warna menjadi kuning setelah diberi penyangga substrat yang mengandung
4-nitrofenilfosfat. Perubahan warna terjadi karena 4-nitrofenil dirubah menjadi
4-nitrofenol yang intensitas warna kuningnya sebanding dengan banyaknya antigen
yang tertangkap oleh antibodi (Clark & Adam 1977; BALITHI 2003)
Di Indonesia, informasi mengenai
penyakit pada tanaman anggrek yang disebabkan oleh CyMV dan keragamannya masih
sangat sedikit. Metode serologi yang telah berhasil dilakukan untuk mendeteksi
CyMV diantaranya yaitu metode ELISA, digunakan untuk mendeteksi pada tanamana
anggrek Grammatophyllum sp. (Silalahi 1992). Diagnosis CyMV juga telah
berhasil dilakukan oleh Hu et al. (1993), dan Sherpa et al. (2007)
dengan menggunakan metode serologi Double Antibody Sandwich (DAS) ELISA
pada tanaman anggrek jenis Arachnis, Aranda, Asocentrum, Cymbidium,
Catteleya, Dendrobium, Oncidium, Phalaenopsis, dan Vanda. Metode serologi
ini menggunakan antiserum monoklonal yang bereaksi secara spesifik dengan
protein selubung virus CyMV (Trigiano et al. 2004).
Deteksi CyMV dengan Teknik Molekuler
Selain
menggunakan metode serologi, deteksi dan identifikasi virus tanaman dapat juga
dilakukan dengan teknik molekuler misalnya Reverse Trancriptase-Polymerase
Chain Reaction (RT-PCR) (Ryu et al. 1995) dan mikroskop elektron
(Akin 2006). Metode ini terdiri atas dua reaksi, yaitu reaksi transkripsi balik
(reverse transcription) yang menggunakan genom RNA virus sebagai cetakan
dan menghasilkan cDNA primer (untai tunggal) serta reaksi penggandaan (PCR)
(Akin 2006). Metode RT-PCR ini telah terbukti dapat digunakan sebagai alat
deteksi virus yang memiliki sensitifitas dan akurasi yang tinggi (Marshall
& Atkinson 1991). Deteksi dengan RT-PCR telah berhasil dilakukan oleh Gara
(1995) untuk mendeteksi CyMV dari tanaman anggrek Vanda. Identifikasi
menggunakan mikroskop elektron dapat dilakukan dengan mengamati bentuk dan
ukuran virion. Berdasarkan bentuk dan ukuran itu, dapat ditentukan jenis virus
yang menyerang suatu tanaman (Akin 2006). Identifikasi virus dengan mikroskop
elektron telah berhasil dilakukan oleh Han et al. Untuk menidentifikasi
CyMV hasil pemurnian dari tanaman anggrek Catteleya spp.
Pengendalian
Tidak
ada cara untuk menyembuhkan tanaman yang memiliki virus . Satu-satunya hal yang
harus dilakukan setelah tanaman terinfeksi adalah untuk menghancurkannya .
Solusi manajemen terbaik adalah untuk mencegah penyebaran penyakit . Hal ini
dicapai melalui desinfeksi yang efektif dari alat yang digunakan dalam budidaya
, termasuk wadah plastik dan pisau cukur . Autoklaf , menyala , dan pengobatan
kimia dengan larutan pemutih trisodium fosfat dan metode tradisional untuk
desinfeksi . Penggunaan Streptomyces filtrat kultur , yang juga telah
ditunjukkan untuk mendisinfeksi sapi gila penyebab penyakit prion , adalah
disinfektan yang menjanjikan . Metode ini terbukti efektif dalam menghilangkan
virus dari berbagai alat , kuku manusia , dan biji anggrek . Strategi manajemen
kemungkinan lain adalah pengembangan ketahanan tanaman . Sebuah usaha untuk
mengubah CymMV gen protein mutan gerakan ke anggrek Dendrobium sedikit sukses (
9 dari 259 tanaman resisten dan menyatakan gen penanda ) ; keberhasilan
transformasi sebenarnya memberikan perlawanan tampaknya terkait dengan
mekanisme membungkam gen pasca transkripsi .
Daftar Pustaka
Akin H M.
2006. Virologi Tumbuhan. Yogyakarta: Kanisius.
[Balithi] Balai
Penelitian Tanaman Hias.. 2003. Intruksi kerja metode virus. Laboratorium
pengujian BALITHI. Cianjur: BALITHI
[Balithi] Balai
Penelitian Tanaman Hias. 2007. Panduan Karakterisasi Tanaman Anggrek. Cianjur:
BALITHI
Burgess G W. 1995.
Prinsip dasar ELISA dan variasi konfigurasinya, teknologi ELISA dalam diagnosis
dan penelitian GW. Burgess (Ed) Wayan T. Ariana (terjemahan). Gajahmada
University Press. Yogyakarta.
Clark M F, Adam AN.
1977. Charateristics of the microplate of enzyme linked imunosorbent assay for
the detection of plant viruses J. gen. virol 34 : 475 – 483
Gara IW. 1995. Studies
on Cymbidium Mosaic Virus Isolated from Vanda Orchid. [thesis]. Japan:
Research Institute for Bioresources, Okayama University
Hu J S, Fereira S, Wang
M , Xu M Q. 1993. Detection of Cymbidium mosaic virus, odontoglossum ringspot
virus, tomato spoted wilt virus, and potyviruses infecting orchids in Hawaii.
Plant disease 77: 464-468.
Lawson, R, H. 1995.
Viruses and their control. Pages 74-104. In: Orchid Pests and Diseases,
American Orchid Society, West Palm Beach, Florida
Lee CS,
Chang CY. 2006. Multiplex RT-PCR detection of orchid viruses with an internal
control of plant nad5 mRNA. Plant Pathology 15: 187-196
Marshall G and Atkinson
D. 1991. Molecular biology: Its practice and role in Crop Protection. Great
Britain: The Lavenham Press Limited.
Miin D O J. 2005.
Screening of a random peptide library with CyMV for potesial development of
diagnostic kits. Malaysia: Malaysia University of Science and Technology.
Navalinskiene M,
Raugalas J, Samuitiene M. 2005. Viral Diseases of Flower Plant 16. Identification
of viruses affecting orchid Cymbidium
Sw. Biologyja 2: 29-34
Ryu KH, Yoon KE dan
Park WM. 1995. Detection by RT-PCR of Cymbidium Mosaic Virus in orchids.
Phytopathology 143:643-646 (15 ref.).
Sherpa A R, Hallan V,
Pathak P, Zaidi A A. 2007. Complete nucleotide sequence analysis of Cymbidium mosaic virus Indian isolate:
futher evidence for evidence for natural recombination potexviruses. Journal Bioscience 32 : 663-669
Syamsiah, Melissa.2011.
Eliminasi Cymbidium mosaic virus pada Plbs Anggrek Dendrobium Menggunakan Zat
Antivirus Ribavarin. Bogor: Institut Pertanian Bogor
Tidak ada komentar:
Posting Komentar